Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SPTSSBQ8NFR3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SPTSSBQ8NFR3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms