Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHDC9Q8NEP7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms