Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LINC00116Q8NCU8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LINC00116Q8NCU8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00116Q8NCU8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms