Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATAD1Q8NBU5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATAD1Q8NBU5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms