Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM87AQ8NBN3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM87AQ8NBN3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms