Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COLGALT1Q8NBJ5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COLGALT1Q8NBJ5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms