Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C17orf53Q8N3J3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C17orf53Q8N3J3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms