Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SVBPQ8N300 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVBPQ8N300 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms