Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJD3Q8N144 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GJD3Q8N144 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms