Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYCP3Q8IZU3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYCP3Q8IZU3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms