Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPUSD2Q8IZ73 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPUSD2Q8IZ73 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms