Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ69

TRMT2A, tRNA (uracil-5-)-methyltransferase homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2AQ8IZ69 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRMT2AQ8IZ69 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRMT2AQ8IZ69 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRMT2AQ8IZ69 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRMT2AQ8IZ69 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRMT2AQ8IZ69 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRMT2AQ8IZ69 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRMT2AQ8IZ69 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRMT2AQ8IZ69 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRMT2AQ8IZ69 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms