Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARID3BQ8IVW6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARID3BQ8IVW6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3BQ8IVW6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARID3BQ8IVW6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.7 ms