Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNGA4Q8IV77 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA4Q8IV77 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA4Q8IV77 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA4Q8IV77 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA4Q8IV77 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNGA4Q8IV77 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms