Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
KCNMB4Q86W47 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KCNMB4Q86W47 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KCNMB4Q86W47 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms