Protein–RNA interactions for Protein: Q86VR7

VSIG10L, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10LQ86VR7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VSIG10LQ86VR7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSIG10LQ86VR7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms