Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPAINQ86UA6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPAINQ86UA6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms