Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NPM2Q86SE8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NPM2Q86SE8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms