Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3BQ7Z3V4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3BQ7Z3V4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3BQ7Z3V4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3BQ7Z3V4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3BQ7Z3V4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE3BQ7Z3V4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE3BQ7Z3V4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE3BQ7Z3V4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms