Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HS2ST1Q7LGA3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HS2ST1Q7LGA3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms