Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SMIM5Q71RC9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMIM5Q71RC9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SMIM5Q71RC9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms