Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP53Q70EK8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP53Q70EK8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP53Q70EK8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP53Q70EK8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP53Q70EK8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP53Q70EK8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
USP53Q70EK8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP53Q70EK8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP53Q70EK8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP53Q70EK8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP53Q70EK8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP53Q70EK8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP53Q70EK8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP53Q70EK8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
USP53Q70EK8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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USP53Q70EK8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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USP53Q70EK8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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USP53Q70EK8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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USP53Q70EK8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
USP53Q70EK8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP53Q70EK8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP53Q70EK8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP53Q70EK8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP53Q70EK8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP53Q70EK8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP53Q70EK8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP53Q70EK8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP53Q70EK8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP53Q70EK8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
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