Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAXIP1Q6ZW49 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PAXIP1Q6ZW49 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAXIP1Q6ZW49 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAXIP1Q6ZW49 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAXIP1Q6ZW49 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAXIP1Q6ZW49 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PAXIP1Q6ZW49 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAXIP1Q6ZW49 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAXIP1Q6ZW49 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms