Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BEND4Q6ZU67 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BEND4Q6ZU67 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms