Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBR3Q6ZT12 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBR3Q6ZT12 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms