Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf47Q6ZRZ4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf47Q6ZRZ4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms