Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LIAT1Q6ZQX7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LIAT1Q6ZQX7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms