Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NSMFQ6X4W1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms