Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LRIG3Q6UXM1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRIG3Q6UXM1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms