Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LCLAT1Q6UWP7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LCLAT1Q6UWP7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms