Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSSK4Q6SA08 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSK4Q6SA08 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms