Protein–RNA interactions for Protein: Q6RVD6

SPATA8, Spermatogenesis-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA8Q6RVD6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SPATA8Q6RVD6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms