Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFWD3Q6PCD5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFWD3Q6PCD5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFWD3Q6PCD5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms