Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6P435 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6P435 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6P435 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6P435 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6P435 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q6P435 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6P435 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6P435 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6P435 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6P435 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6P435 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6P435 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6P435 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6P435 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6P435 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q6P435 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6P435 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6P435 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6P435 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6P435 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6P435 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6P435 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6P435 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6P435 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6P435 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6P435 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6P435 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6P435 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6P435 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6P435 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6P435 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6P435 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q6P435 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6P435 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6P435 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6P435 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6P435 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6P435 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6P435 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6P435 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6P435 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6P435 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6P435 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6P435 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6P435 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6P435 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6P435 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6P435 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q6P435 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6P435 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6P435 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6P435 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6P435 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6P435 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6P435 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6P435 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6P435 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6P435 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6P435 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6P435 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6P435 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6P435 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q6P435 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6P435 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6P435 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6P435 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6P435 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6P435 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q6P435 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6P435 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6P435 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6P435 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6P435 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6P435 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6P435 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6P435 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6P435 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6P435 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6P435 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6P435 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q6P435 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6P435 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6P435 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6P435 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6P435 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6P435 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6P435 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6P435 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6P435 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6P435 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6P435 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6P435 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6P435 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q6P435 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6P435 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6P435 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6P435 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6P435 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q6P435 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms