Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REEP3Q6NUK4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
REEP3Q6NUK4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
REEP3Q6NUK4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
REEP3Q6NUK4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP3Q6NUK4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP3Q6NUK4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP3Q6NUK4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
REEP3Q6NUK4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms