Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RCSD1Q6JBY9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RCSD1Q6JBY9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms