Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TYW3Q6IPR3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TYW3Q6IPR3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms