Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGALS9CQ6DKI2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms