Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
INTS3Q68E01 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
INTS3Q68E01 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms