Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG16L1Q676U5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG16L1Q676U5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms