Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf57Q5W0N0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf57Q5W0N0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms