Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZB9

DMRTA1, Doublesex- and mab-3-related transcription factor A1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRTA1Q5VZB9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DMRTA1Q5VZB9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DMRTA1Q5VZB9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms