Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRAMEF5Q5TYX0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRAMEF5Q5TYX0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms