Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HECTD3Q5T447 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HECTD3Q5T447 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms