Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC122Q5T0U0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC122Q5T0U0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms