Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CEP170Q5SW79 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CEP170Q5SW79 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CEP170Q5SW79 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms