Protein–RNA interactions for Protein: Q5PR19

Putative UPF0607 protein LOC392364, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5PR19 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q5PR19 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5PR19 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5PR19 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5PR19 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5PR19 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5PR19 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5PR19 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5PR19 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5PR19 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5PR19 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5PR19 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5PR19 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5PR19 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q5PR19 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5PR19 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5PR19 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5PR19 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5PR19 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5PR19 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5PR19 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5PR19 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5PR19 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5PR19 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5PR19 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5PR19 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5PR19 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5PR19 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5PR19 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q5PR19 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q5PR19 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q5PR19 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q5PR19 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q5PR19 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q5PR19 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q5PR19 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q5PR19 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q5PR19 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q5PR19 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q5PR19 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q5PR19 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q5PR19 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q5PR19 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q5PR19 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q5PR19 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q5PR19 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q5PR19 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q5PR19 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q5PR19 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q5PR19 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q5PR19 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q5PR19 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q5PR19 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q5PR19 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q5PR19 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q5PR19 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q5PR19 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q5PR19 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5PR19 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5PR19 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5PR19 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5PR19 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5PR19 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5PR19 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5PR19 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5PR19 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5PR19 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5PR19 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5PR19 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5PR19 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5PR19 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q5PR19 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5PR19 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5PR19 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5PR19 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5PR19 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5PR19 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5PR19 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5PR19 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5PR19 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5PR19 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5PR19 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5PR19 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5PR19 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5PR19 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q5PR19 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q5PR19 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms