Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNT1Q5JUK3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT1Q5JUK3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms