Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR44Q5JSH3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
WDR44Q5JSH3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WDR44Q5JSH3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms