Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRDTQ58F21 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRDTQ58F21 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms